O período de transição foi mais difícil e conturbado do que se esperava. O SINTEST/RN passou ainda um bom tempo funcionando no prédio da Afurn e recebendo os repasses – cerca de um ano a mais do que os seis meses previstos – até que todo processo de reestruturação fosse completado. As primeiras sindicalizações começaram a ser feitas na própria Afurn, no primeiro semestre de 1997. Mas as mudanças só vieram mesmo no ano de 1998. Historicamente esse foi o momento mais importante da vida do sindicato. Com a ajuda do então Prefeito do Campus, Joseleno Marques, mudou-se para a Casa de Pedra, localizada na Praça Cívica da UFRN do Campus Central, sem nenhum custo.
